荧光斑马鱼不是染色的。概括来说它们是科学研究的产物，经过科研人员导入荧光蛋白基因，经过多代培育，有部分荧光蛋白基因稳定下来可遗传到后代中。

荧光斑马鱼和普通斑马鱼的习性特征是一样的，只是身体里多含了荧光蛋白基因。区分荧光斑马鱼的公母，和普通斑马鱼一样，很好区分，半年龄(6个月)斑马鱼即到了成熟期，雌性斑马鱼的肚子鼓而大，各个鱼鳍都比较短而圆;公斑马鱼身材细长，各个鱼鳍长而尖，颜色比母鱼艳丽。