石燕鸟能活5-10年，石燕鸟通常营巢于河谷与溪流岸边，巢多置于岸边悬岩洞隙、岩石或土坎下凹陷处，也在岸边岩石终逢隙和树洞中营巢。巢呈杯状或碗状，通常隐蔽很好，不易被发现。巢主要由枯草茎、枯草叶、草根、细的枯枝、树叶、苔藓、地衣等材料构成，内垫有细草茎和草根，有时垫有羊毛、纤维和羽毛。

繁殖期3-7月。主要由雌鸟营巢，雄鸟仅偶参与营巢活动。每窝产卵3-6枚，多为4-5枚，卵呈卵圆形或长卵圆形，白色或黄白色，也有呈淡绿色或蓝绿色的，被有褐色或淡赭色斑点。雌鸟孵卵，雏鸟晚成性，雌雄亲鸟共同育雏。