体型区别

在成年之后，迷你麝香龟和普通麝香龟的体型是有区别的。成年后的迷你麝香龟看起来是比较长、而且比较窄的，总体看起来是椭圆形的。而普通麝香龟则不同，看起来圆圆的。

腹甲长度区别

迷你麝香龟不论公母，它们都是比较小巧的，腹甲的长度基本不会超过10厘米，一般来说母龟的腹甲在7厘米左右，公龟的腹甲则在5厘米左右，这也是它们得名的原因。而普通的麝香龟体型则相对来说会大一些。

背甲颜色区别

二者的背甲颜色也是不同的，迷你麝香龟的背甲颜色相对来说是比较深的，但普通麝香龟的背甲颜色则比较浅。而且，它们背甲的花纹形状也有差异，迷你麝香龟的花纹一般是豹纹或者点状的，而普通麝香龟的花纹形状则是放射状的。