扁东方龟的食性较广，稻谷、小麦、豌豆、小鱼、虾、昆虫、蜗牛等均吃，其中最喜欢吃的食物是小鱼、蜗牛、玉米和稻谷。人工饲养时，为满足山龟生长所需要的各种营养，避免因饲料单一而生长发育不良和产生厌食症，应采用多种饲料，如动物性饲料中的鱼虾、蜗牛、河蚌等和植物性饲料中的稻谷、小麦、玉米等。

要想让扁东方龟充分地消化这些饲料，在投喂饲料之前，须先将玉米、豌豆等压碎，浸泡2小时左右，其他大块食物也须先切碎，然后才投喂。还须注意的是，在扁东方龟生长的不同时期，应根据其生长特点投以含不同营养成分的饲料。